A cidade é reconhecida nacional e internacionalmente pela sua boa gestão em arborização urbana, sendo um dos três municípios brasileiros que possuem 6 reconhecimentos consecutivos do Programa “Tree Cities of the World” da FAO/ONU.
O acervo arbóreo das vias públicas está sendo inventariado e já são mais de 82.000 árvores identificadas com placas de QR Code que podem ser lidas pelos cidadãos, onde são disponibilizadas informações sobre os espécimes cadastrados.
São José dos Campos também é o primeiro município brasileiro a ser reconhecido pela ABNT (Associação Brasileira de Normas Técnicas), como Cidade Inteligente, Resiliente e Sustentável.
Em 2024 o município aderiu ao programa “Cidades Carbono Neutro”, lançado pelo IPT (Instituto de Pesquisas Tecnológicas de São Paulo) e FAPESP (Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo). O programa visa auxiliar as cidades no enfrentamento das mudanças climáticas.
Outros destaques são o “Programa Nascentes”, que através de ações coordenadas por equipe técnica, e com a participação da população, realiza ações de plantio e manutenções em 38 nascentes localizadas em áreas urbanas da cidade.
Já o “Programa Primatas” faz o acompanhamento e desenvolve ações para preservação das populações de primatas ameaçadas de extinção existentes na cidade.